Chères amies et chers amis de la Systématique,

Nous vous invitons au prochain CaféSystéma qui se tiendra cette semaine, le jeudi 9 février à partir de 17h sur notre chaîne Twitch.

Pour cette septième émission, nous aurons deux chroniques présentées par Laetitia Carrive et Elie Saliba, suivi par notre invité mensuel en la personne de Romain Nattier qui viendra nous parler de « Faire du neuf avec du vieux: apport des specimens de musée dans la phylogénomique ».

Venez nombreux !

Le lien vers la chaîne Twitch : https://www.twitch.tv/sfsystematique

Chères amies, chers amis de la Systématique,

La Société Française de Systématique remet le prix annuel dédié à la mémoire de Jacques Lebbe. Ce prix d’une valeur de 300 euros et de trois ans d’adhésion à la SFS a pour but de soutenir les étudiants en récompensant des travaux de mémoire M2 développés en systématique, qu’elle soit théorique ou appliquée à une étude de cas. 
Pour plus de détails, ainsi que pour les modalités de candidature veuillez cliquer sur l’adresse suivante : https://sfs.infosyslab.fr/index.php/prix_lebbe/

Nous vous invitons d’envoyer vos candidatures à l’adresse syst.contact@gmail.com  jusqu’à la date limite du 26 février 2023.

Bien cordialement,
la SFS

Chères amies, chers amis de la Systématique,

Nous vous invitons au prochain CaféSystéma qui se tiendra la semaine prochaine, le jeudi 26 janvier à partir de 17h sur notre chaîne Twitch.

Pour cette sixième émission, nous retrouverons nos chroniqueurs habituels, avec E. Saliba qui continuera à nous parler des Types et N. Bekkouche qui nous présentera les vers Osedax.

Mais ce n’est pas tout, nous accueillons deux nouvelles chroniqueuses, à savoir Diane Dabir qui nous parlera de la situation taxonomique de la corneille noire et Laëtitia Carrive qui nous présentera l’espèce Amborella trichopoda et sa situation systématique.

Pour finir, l’invité du mois sera Donald Davesne, qui viendra nous présenter ses travaux sur la duplication du génome chez les Téléostéen.

Venez nombreux !

Le lien vers la chaîne Twitch : https://www.twitch.tv/sfsystematique
Bien cordialement,
la SFS

Chères amies, chers amis de la Systématique,

Attention : les journées 2023 de la Société Française de Systématique arrivent !

Il s’agit de se retrouver pour mettre de l’ordre dans nos concepts de systématique (par ex. phylogénie, taxon, forme, homologie, individu, systématique, ontogenèse, écosystème, et bien plus encore).

Le but ? Reconnaitre les similitudes et différences entre les utilisations de nos concepts et repartir avec un premier jet d’une base de connaissance sur tout ce qu’on aura discuté. Pas obligé de se mettre d’accord mais au moins de bien savoir pourquoi !

Le format ? Un peu différent de nos habitudes. Peu de conférences mais plutôt des ateliers de travail en petits groupes sur les différents concepts.

Que vous soyez utilisateur de ces concepts, producteur, théoricien, législateur… Votre participation est capitale. La qualité du produit de ces journées dépend de la diversité des participants. Alors n’hésitez pas à réserver la période du lundi 15 au mercredi 17 mai 2023 pour venir à Paris construire avec nous cet ambitieux projet et à remplir ce petit formulaire de préinscription jusqu’au vendredi 31 mars  [https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSeE2pTO6n8OwvVwt3iAFebhdK4EfQCpbWoMyN8okuINs6PxVw/viewform?usp=sf_link].

Ces journées sont proposées par la Société Française de Systématique, l’Institut d’Histoire et de Philosophie des Sciences et des Techniques et en partenariat avec le Centre de Recherche en Paléontologie – Paris. D’autres informations suivront très prochainement sur les conditions de déroulement des journées.

N’hésitez pas à en parler autour de vous.

Bien cordialement, 

La SFS

Journées 2023 de la Société Française de Systématique

Remue-méninges en systématique, 
discussions et clarification des concepts

   Les variations de la biosphère sont complexes. L’objectif de la systématique est d’y mettre de l’ordre. Elle définit les entités qui rendent la biosphère intelligible et qui nous permettent de communiquer. Elle propose également les règles pour établir ces concepts de classification et assurer la cohérence de l’édifice en résultant. Ceci dit, certains de ces concepts ont plusieurs acceptions communes, ont parfois des définitions différentes voire incompatibles. Les concepts de la systématique sont victimes d’ententes verbales (polysémies) et de disputes verbales (on parle de la même chose avec des mots différents). Cela implique des incohérences dans les classifications produites, dégrade la qualité de la perception de la biodiversité et corrompt les méta-analyses basées sur les instances de ces concepts (courbes de biodiversité, phylogénies …). La SFS propose des journées destinées à débroussailler la forêt des concepts en systématique. Quelles sont ces entités ? Comment les définissons-nous ? Comment les reconnaissons-nous ? Nous engageons ce débat dans la communauté francophone pour cartographier nos usages, reconnaître nos similitudes, différences et complémentarités. L’objectif de ces journées n’est pas de résoudre les problèmes ni de se mettre d’accord ; mais plutôt de reconnaître la variabilité de concepts de la systématique pour produire une base de connaissances de référence. Elle devrait servir de point de départ pour des travaux théoriques sur ces concepts mais également à préciser la nature des concepts pour celles et ceux qui les utilisent ou les produisent au quotidien.

Chères amies, chers amis de la Systématique,

Les journées annuelles de la Société Française de Systématique se déroulent cette année à l’Université de Rennes 1 du 15 au 17 juin. Ce sont Maxime HervéStéphane Derocles et Paul Simion qui nous invitent à discuter les contours de l’espèce (présentation ci-dessous). Ce thème vous inspire ? N’hésitez pas à nous communiquer vos propositions de communications orales et / ou posters (orateur, titre et un court résumé) jusqu’au vendredi 27 mai. Les inscriptions seront ouvertes le 2 mai. Pour toute information ainsi que pour le dépôt de communications vous pouvez consulter le site dédié aux journées https://fr-systematique.sciencesconf.org/, ainsi que le site de la SFS https://sfs.infosyslab.fr/. Ces journées seront prioritairement en présentiel même s’il sera possible de les suivre à distance.
L’assemblée générale de la SFS aura également lieu le 17 juin. 

Nous espérons nous retrouver nombreux et nombreuses pour faire le point sur ce concept fondamental, parfois insaisissable et totalement systématique qu’est l’espèce !

La SFS

——

LES CONTOURS DE L’ESPÈCE: CONCEPTS, APPROCHES ET APPLICATIONS

La systématique a pour objectif l’établissement de systèmes qui organisent la compréhension du vivant, dans son histoire évolutive et dans sa diversité. Ses systèmes de classification reposent sur le concept fondamental d’espèce. Mais comment définir une espèce ? La biodiversité est un continuum produit par des processus évolutifs eux-même continus, alors comment la discrétiser, comment établir les contours des espèces ?

De nombreux concepts d’espèce ont été proposés au fil de l’histoire de la systématique et avec eux de nombreux critères de délimitation d’espèces ont été développés. Faudrait-il concevoir l’espèce à l’échelle des organismes, des génomes ou bien de l’histoire évolutive ? La reconnaissance d’unités de reproduction est obscurcie par les hybridations et les processus continus de spéciation, tandis que celle des unités de structure est obscurcie par la diversité cryptique, et que celle des unités moléculaires est obscurcie par des événements évolutifs horizontaux. Complexe, parfois controversée, la délimitation des espèces est pourtant fondamentale pour l’étude de la biodiversité, en biologie évolutive comme en écologie.

Quel concept de l’espèce, quelle méthode de délimitation choisir pour quel domaine d’étude ?Est-il possible de réconcilier les notions d’espèces dans un concept unifié, intégratif ? Quelles sont les conséquences de la mise en œuvre d’une approche plutôt qu’une autre sur notre compréhension du vivant ?

Cette année, les journées de la SFS plongeront au cœur de la notion centrale de la systématique en accueillant des intervenants qui discuteront des différents concepts possibles de l’espèce, des différentes approches et critères permettant d’en dessiner les contours, et de la mise en application de ces méthodes en systématique et en écologie.

Maxime HERVÉ, Stéphane DEROCLES & Paul SIMION.

Chères amies, chers amis de la Systématique,

La Société Française de Systématique remet un prix annuel dédié à la mémoire de Jacques Lebbe. Ce prix d’une valeur de 300 euros et de trois ans d’adhésion à la SFS a pour but de soutenir les étudiants en récompensant  des travaux de mémoire M2 développés en systématique, qu’elle soit théorique ou appliquée à une étude de cas. 
Pour plus de détails, ainsi que pour les modalités de candidature veuillez cliquer sur l’adresse suivante : https://sfs.infosyslab.fr/index.php/prix_lebbe/ 

Nous vous invitons d’envoyer vos candidatures à l’adresse syst.contact@gmail.com  jusqu’à la date limite du 29 avril 2022.

Bien cordialement,
la SFS

Chères amies, chers amis de la Systématique,

La SFS est membre de la Fédération BioGée dont les premières journées annuelles se tiendront à Rouen les 20, 21 et 22 mai 2022 sur le thème de la renaturation et de « la nature en ville ».

A cette occasion, BioGée est à la recherche de volontaires pour :

–          aider, voire tenir un stand de la SFS dans le salon du livre, à l’entrée des conférences des 20 et 21 mai ;

–          animer des sorties nature ou santé en ville (tous frais payés).

Si vous êtes intéressé(e) pour aider à l’organisation de ces journées, n’hésitez pas à contacter la fédération BioGée par l’intermédiaire d’un formulaire de contact disponible sur leur site (www.biogee.org/index.php/contact/)

Par ailleurs, vous trouverez également sur le site de BioGée, le bilan de l’audience du 22 novembre 2021 auprès du cabinet du ministère de l’éducation nationale de la jeunesse et des sports et le Relevé de recommandations de BioGée sur la formation en sciences et technologies du vivant, de la Terre et de l’environnement pour le professorat des écoles.

Les orientations de ce texte font écho et complètent les conclusions des journées SFS 2021 sur « Enseigner la systématique (aujourd’hui et demain) ».

Bien cordialement,

la SFS

Chères amies, chers amis de la Systématique,

Après leur report à cause de la situation sanitaire, nous avons le plaisir de vous annoncer que les prochaines journées annuelles de la systématique « Enseigner la Systématique : aujourd’hui et demain », organisées par Guillaume Lecointre et Régine Vignes-Lebbe, se tiendront en présentiel du lundi 27 septembre 2021, 13h au mercredi 29 septembre 2021, 13h. Les journées auront lieu dans le grand amphithéâtre d’entomologie du Muséum national d’Histoire naturelle à Paris, 45 rue Buffon.

Enseigner la systématique (aujourd’hui et demain)

L’enseignement de la systématique, que ce soit à l’école élémentaire ou à l’université, est longtemps resté obsolète, accusant deux siècles et demi de retard par rapport aux productions de ce domaine scientifique. Quant aux méthodes et aux intentions de la systématique, elles restaient dans le non-dit. Cet état de fait n’est pas étranger au déclin de visibilité de la discipline dans la seconde moitié du vingtième siècle. Depuis le début du siècle présent, les choses ont changé. La systématique est redevenue visible, par des chemins détournés : les préoccupations à l’égard de la perte de biodiversité, la popularisation de la phylogénie, l’engouement pour l’approche moléculaire de la caractérisation de la biodiversité. À travers les clés de détermination, la systématique s’illustre par une approche pragmatique de la biodiversité. Par les classifications, elle adopte une approche ontologique. Par la phylogénie, elle manifeste son cahier des charges historique. Continue-t-on à confondre les trois dans l’enseignement ? Lesquelles de ces composantes sont-elles enseignées, et à quels niveaux ? Vingt ans après le rapport de l’Académie des Sciences sur l’état de la Systématique en France, quinze ans après la journée de la SFS consacrée à l’enseignement de la systématique, les acteurs du changement viendront en témoigner, de l’école élémentaire jusqu’au master, avec également un regard sur l’enseignement de la systématique dans des pays francophones voisins. Nous aborderons aussi la question des débouchés en systématique, sous l’angle de la recherche et celui de l’expertise.

Vous pouvez vous inscrire sur le lien : https://fr-systematique.sciencesconf.org/registration

Programme :

Lundi 27 septembre 2021


13h-13h10 : Accueil du Président de la Société Française de Systématique, Jérémie Bardin

13h10-13h30 : Régine VIGNES-LEBBE, Professeur de Sorbonne Université et Guillaume LECOINTRE, Professeur du Muséum national d’Histoire naturelle

Introduction


13h30-14h : Sébastien TURPIN, Coordinateur Vigie-Nature-École

Vigie-Nature-école


14h15-14h45 : Claude GUINTARD, Dr. Vétérinaire, Responsable de l’Unité d’Anatomie Comparée de l’École Nationale Vétérinaire de Nantes – Oniris.

La place de la systématique dans le cursus vétérinaire en France en 2020


15h-15h30 : Jérôme DEPAQUIT, Professeur de Parasitologie-Mycologie médicale à la Faculté de Pharmacie de Reims, & Hubert FERTÉ, Maître de Conférences émérite de parasitologie à la Faculté de Pharmacie de Reims

Existe-t-il un avenir pour l’enseignement de la systématique dans les formations de santé ?


15h45-16h : Pause


16h-16h30 : Valéry MALÉCOT, Maître de Conférences de l’enseignement supérieur agricole, à l’Institut Agro, Agrocampus Ouest

La systématique dans les formations horticoles et les écoles d’ingénieurs agronomes


16h45-17h15 : Jean-François FLOT, Chargé de Cours, Biologie évolutive & Écologie, Université Libre de Bruxelles

« As simple as possible, but no simpler » : les simplifications abusives dans l’enseignement de la systématique en Belgique



Mardi 28 septembre 2021


9h-9h30 : Monique DUPUIS, Inspectrice Générale de l’Éducation, du Sport et de la Recherche (IGESR) – groupe STVST (Sciences et technologies du vivant, de la santé et de la Terre)

Rétrospective sur les programmes scolaires français en systématique


9h45 – 10h15 : Robin BOSDEVEIX, Docteur en didactique des SVT et inspecteur général de l’éducation, du sport et de la recherche (IGÉSR)

Didactique de la systématique


10h30-11h : Sophie MATHÉ et Émilie DÉTOUILLON, enseignantes, responsables du pôle de formation des enseignants du premier et second degré au MNHN.

La formation des enseignants à l’enseignement de la classification et de la phylogénie au MNHN


11h-11h30 : Pause

11h30-12h : Bernard RIÉRA, Chargé de recherche CNRS affecté à l’UMR MECADEV et co-responsable des parcours BEVT et Tropimundo (Erasmus Mundus)

Regard sur la Systématique dans des universités du sud


14h30-15h : Martine SACHE-VELLA et Guillaume LECOINTRE, IA IPR Établissements et vie scolaire, ex inspectrice de l’éducation nationale, pilote du groupe national des IEN sciences

État des lieux de l’enseignement de la systématique au cours moyen


15h15-15h45 : Annabelle KREMER-LECOINTRE et Guillaume LECOINTRE (sous réserve), enseignante agrégée de SVT

Classification au collège et pratiques innovantes en inter-degrés


16h-16h15 : Pause


16h30-17h : Johann GÉRARD, IA-IPR de l’Académie de Rennes

État des lieux : une spiralité à interroger du collège au lycée



Mercredi 29 septembre 2021

9h-9h30 : Jean-Yves DUBUISSON, Professeur de Sorbonne Université

Enseignement de la systématique en Licence généraliste : l’exemple de SU

9h45-10h15 : Maxime HERVÉ, Maître de Conférences en biologie animale à l’Université de Rennes I

L’enseignement de la systématique animale en Licence et en préparation CAPES-Agreg à Rennes 1


10h30-11h : Frédéric LEGENDRE et Véronique BARRIEL ; Maître de Conférences du Muséum national d’Histoire naturelle

L’enseignement de la systématique dans les masters


11h-11h15 : Pause


Séquence des débouchés (15 mn chacun) :


11h15-11h30 : Pierre-Olivier ANTOINE, Professeur à l’Université de Montpellier, et François BONHOMME, Directeur de Recherches à l’Institut des Sciences de l’Évolution de Montpellier

La systématique à Montpellier et sa place à l’Université et dans les laboratoires.

11h30-11h45 : Donald DAVESNE et Véronique BARRIEL, chercheur post-doctorant

Les débouchés du M2 Systématique, Évolution et Paléontologie (MNHN-SU)


11h45-12h : Nathalie MACHON, direction de l’école doctorale « Sciences de la nature et de l’Homme » (ED 227)

Les débouchés après une thèse en systématique à l’ED 227

12h-13h : Table Ronde et synthèse des journées

Avec les témoins Gérard GUILLOT, enseignant au collège, Marie-Laure LE LOUARN, enseignante à l’école élémentaire, Aurélien MIRALLES, chercheur post-doc, Guillaume LECOINTRE, Jérôme MURIENNE, chercheur CNRS, et Régine VIGNES-LEBBE

Bien cordialement,
la SFS

Chères amies, chers amis de la Systématique,

Nous avons le plaisir d’accueillir Nicolas Puillandre (MCF MNHN-Paris) pour la prochaine conférence des CaféSystema, intitulée « DNA Barcoding, taxonomie ADN et taxonomie intégrative : séparer le bon grain de l’ivraie ». La séance aura lieu le 28 juin de 18h00 à 19h30 en visioconférence.

Dans le cadre de ces séances et afin de favoriser le dialogue autour de la Systématique nous vous proposons la chronique Taxarium, animée par Nicolas Bekkouche. Un taxon particulier sera présenté par séance. De même que la chronique Lexicon, qui portera sur le vocabulaire de la nomenclature, sera animée par Elie Mario Saliba. Un concept sera également présenté par séance.


Résumé Conférence (Nicolas Puillandre) : 
Les développements conceptuels et méthodologiques des deux dernières décennies ont permis un regain d’intérêt pour la taxonomie alpha, même si le chemin pour combler le “déficit taxonomique” reste long. En particulier, le « problème de l’espèce » ne semble plus si insoluble, et la distinction entre le cadre conceptuel et l’approche pratique de délimitation d’espèce a fait évoluer les pratiques. L’exposé reviendra sur l’essor des approches moléculaires, et notamment des projets de type « DNA Barcoding », qui ont joué un rôle moteur pour la taxonomie, et sur l’intégration de différents types de caractères dans un contexte intégratif qui permet de formaliser l’approche de délimitation d’espèces et de renforcer la robustesse des hypothèses taxonomiques. J’insisterai notamment sur les méthodes de délimitations d’espèces basées sur des séquences ADN, et sur les plateformes SpartExplorer et iTaxoTools, actuellement en développement. Je terminerai par présenter quelques exemples de taxonomie intégrative chez les gastéropodes Conoidea, en insistant sur l’impact que les hypothèses taxonomiques peuvent avoir dans d’autres domaines scientifiques.

Résumé Taxarium (Nicolas Bekkouche) : « Bref aperçu de l’étonnante diversité des Heterotardigrada (Tardigrada, Ecdysozoa, Metazoa) »
On a tous entendu parler du tardigrade, cet animal microscopique qui semble pouvoir résister à toutes les conditions extrêmes qu’on a l’originalité de leur faire subir. Ces tardigrades appartenant bien souvent à la classe « Eutardigrada ». Mais comme souvent lorsqu’un organisme est mis sous les projecteurs, leurs congénères sont quelque peu mis de côté. Nous allons donc faire un bref tour de la classification et de la diversité des Heterotardigrades, portant parfois d’incroyables appendices et ornementations, et aux modes de vie variés.

Résumé Lexicon (Elie Saliba) : « Nom scientifique »
Les scientifiques utilisent des noms pour désigner des taxons d’êtres vivants se démarquant de ceux utilisés par le grand public. Ces noms, dits noms scientifiques, se veulent non-ambigus, universels et communicables. Mais le concept de nom scientifique, largement utilisé, n’est pas toujours facile à délimiter à travers le monde et l’Histoire. Qu’est-ce exactement qu’un nom scientifique ?


Participer à la réunion Zoom https://zoom.us/j/99680545330?pwd=cFVUc1NtMFZpNlRYa1BKR2l6ZUtsdz09
ID de réunion : 996 8054 5330 Code secret : 8hxWGD


En espérant vous retrouver nombreux à ce deuxième CaféSystema !

Bien cordialement,

la SFS

Chères amies, chers amis de la Systématique,


C’est avec un immense plaisir que nous vous invitons toutes et tous à participer à la première séance des « CaféSystema » : les tous nouveaux rendez-vous mensuels de la société. Ce récent projet de la SFS a pour objectif de créer un rendez-vous régulier pour les systématiciens francophones, afin de diffuser et d’échanger les résultats ou débats actuels des multiples domaines de la discipline. Nous souhaitons de cette manière la rendre plus visible et la défendre. Nous espérons aussi que ces séances seront un formidable moment d’échanges entre les membres de la SFS mais aussi avec un public plus large, qui bien souvent méconnaît le rôle et l’utilité de la systématique.


Nous vous proposons dans un premier temps un format par visioconférence simple (via la plateforme Zoom), mais nous travaillons actuellement à un format hyper-interactif susceptible d’optimiser la diffusion des connaissances. Nous espérons que vous en profiterez avec joie très prochainement ! A suivre…


Nous aurons donc le plaisir d’inaugurer les CaféSystema avec une conférence de Frédéric Legendre (MCF, MNHN-Paris), intitulée: « Origine de l’eusocialité chez les termites : taxons fossiles et datations phylogénétiques ». Elle aura lieu le mardi 4 mai de 18h30 à 19h30.


Résumé :


L’eusocialité, système social hautement intégré avec des reproducteurs et des castes stériles, est souvent avancé comme facteur majeur expliquant le remarquable succès évolutif et écologique des termites. Retrouvée chez une douzaine de lignées animales, l’eusocialité serait apparue en premier chez les termites. Mais son âge d’origine ne fait pas consensus, ce qui limite notre compréhension des facteurs sous-jacents à son évolution. Dater cette origine, et celles des diverses lignées de termites, est donc un enjeu important qui requiert de faire dialoguer registre fossile et hypothèses phylogénétiques. Or, les datations moléculaires se contentent de quelques points de calibrations fossiles, alors que, pour les termites toujours, les auteurs utilisant des approches de parcimonie fournissent des estimations d’âges éclairées par leur seule connaissance du registre fossile. Il en résulte des estimations divergentes, parfois de plusieurs millions d’années. Profitant d’avancées sur les méthodes de datations, j’utiliserai l’exemple de l’origine de l’eusocialité chez les termites pour présenter le ‘fossilized birth-death model’, tel qu’implémenté dans MrBayes. Ce modèle permet d’intégrer les taxons fossiles et actuels dans les analyses de datations reposant sur des arbres phylogénétiques. Les résultats suggèrent que l’origine de l’eusocialité chez les termites pourrait être encore plus ancienne que supposée (ca. 200 Mya).


Participer à la réunion Zoom :

https://zoom.us/j/91696442917?pwd=TktFQXVZdDJ3b1ltV3o3ZUM5Sk5KUT09

ID de réunion : 916 9644 2917

Code secret : 6mNiP0

En espérant vous retrouver nombreux à ces rendez-vous,

Bien cordialement,

la SFS