Le vendredi 22 Avril à 14 heures à l’amphi Rouelle, Guillaume Lecointre et l’équipe des philosophes de l’école normale supérieure de Lyon examineront la notion d’individu, du point de vue biologique et du point de vue philosophique.
Séminaire Philosophie & Biologie
Marcel Weber (Professor in Philosophy): What’s Special About Genes? Causal Specificity, Information, and Genetic Causation
Mercredi 27 avril 2016, 12h-13h30
Journées Annuelles de la Société Française de Systématique 2016 : Phylogénie, taxonomie et nomenclature
Journées Annuelles de la SFS – les 10 et 11 septembre 2016, à l’Aigle
Formulaire d’inscription, journées 2016
Chers collègues,
Cette année, le thème des Journées Annuelles de notre société est intitulé « phylogénie, taxonomie et nomenclature ». Ce thème est au cœur des problématiques de notre société, puisque la taxonomie moderne est censée refléter la phylogénie, et que notre nomenclature doit permettre de nommer les taxons, dont la plupart sont censés être des clades, au moins pour les taxons supra-spécifiques. Ainsi, la demi-journée que nous espérons consacrer à cette thématique abordera ces trois thèmes (phylogénie, taxonomie et nomenclature), ainsi que le lien qui existe, ou qui devrait exister, entre ces domaines. Ce lien ne fait pas l’unanimité ; ainsi, certains auteurs (e.g. Benton, 2000) contestent l’idée maintenant assez bien établie que les taxons supraspécifiques doivent forcément être monophylétiques, ce qui implique que le lien entre phylogénie et taxonomie soit imparfait. D’autres contestent que notre système de nomenclature devrait être conçu pour nommer des clades (Dubois, 2007 : 43), car ceci suppose un modèle surtout divergent d’évolution, alors que certains phénomènes (hybridation et transferts horizontaux) causent de la réticulation. Les taxons considérés comme des espèces posent une série d’autres problèmes, car leur ontologie est floue (Ereshefsky, 2002) : s’agit-il de clades, de communautés de reproduction, de lignées évolutives, d’une combinaison de deux ou trois de ces entités, ou encore d’autre chose ? On ne sera pas surpris d’apprendre que plus d’une centaine de définitions de l’espèce ont été proposés (Lherminier & Solignac, 2005). Peut-on et doit-on et doit-on appliquer les mêmes règles de nomenclature aux espèces qu’aux taxons de rang supérieur ? Les catégories linnéennes, qui constituent, avec les types, le fondement de la nomenclature Linnéenne-Stricklandienne légiférée par les codes de nomenclature traditionnels (code zoologique, botanique et bactériologique, principalement), ont été fortement critiquées (Laurin, 2008). Sont-elles adaptées à la nomenclature des taxons, ou devraient-elles être abandonnées en faveur de systèmes alternatifs, comme le PhyloCode (Cantino & de Queiroz, 2010) ou la nomenclature cladotypique (Béthoux, 2007) ? Voici quelques-unes des questions qui pourront être abordées dans cette séance thématique, puis débattues lors la table-ronde qui aura lieu à la fin de cette séance et qui impliquera tous les participants du congrès qui le souhaiteront.
Bien entendu, le reste des journées sera consacré aux présentations libres et aux événements habituels, comme l’assemblée générale, la remise du prix Jacques Lebbe, etc. Le tout, dans le cadre exceptionnel d’un beau château de la Renaissance situé dans un site calme (3 km à l’extérieur de l’Aigle), ce qui promet une convivialité sans précédent pour nos journées. Nous espérons vous voir nombreux !
Michel Laurin et Philippe Lherminier
Références :
Benton, M.J., 2000. Vertebrate Palaeontology, Blackwell, Oxford, 452 p.
Béthoux, O., 2007. Propositions for a character-state-based biological taxonomy. Zoologica Scr. 36, 409–416.
Cantino, P.D., de Queiroz, K., 2010. PhyloCode: a phylogenetic code of biological nomenclature. Version 4c.
Dubois, A., 2007. Phylogeny, taxonomy and nomenclature: the problem of taxonomic categories and of nomenclatural ranks. Zootaxa 1519, 27–68.
Ereshefsky, M., 2002. Linnaean ranks: Vestiges of a bygone era. Phil. Sci. 69, S305–S315.
Laurin, M., 2008. The splendid isolation of biological nomenclature. Zoologica Scr. 37, 223–233.
Lherminier, P., Solignac, M., 2005. L’espèce, Syllepse, Paris, 694 p.
Informations pratiques :
Hôtels suggérés à l’Aigle
– Le Cygne, 31 rue Saint-Barthélémy, l’Aigle. Chambres simples à 54€; doubles à 57€; 7 chambres disponibles en tout. Tel. 02 33 34 80 75.
– Le Dauphin, Place de la Halle, l’Aigle. Chambres à 85 à 102€; doubles de 94 à 111€; triples de 131 à 148€; 20 chambres disponibles. Tel. 02 33 84 18 00.
– Le Piazza Café, 7 Place Boislandry, l’Aigle. 2 chambres doubles à 45 €; 2 triples à 60€. Tel. 02 33 24 69 50.
– Pub brasserie O’Château, 11 Place de Saint-Martin, l’Aigle. 5 chambres à 55 € petit déjeuner compris (sauf dimanche, 5€/personne). Tel. 02 33 24 00 97.
Ces hôtels sont en ville, à 3km du Château (lieu de notre Congrès), ce qui facilitera le transport entre les hôtels et le château du Fontenil, soit par co-voituraga, soit par taxi (ou par vélo, pour les sportifs). Certains ont déjà des réservations pour cette période, alors vous devriez réserver le plus tôt possible. Il y a aussi de charmants gites ruraux dans la région, mais il vaut mieux disposer d’une voiture pour s’y rendre.
Young Natural History scientists Meeting 3rd edition
Demain matin, la session systématique, phylogénie et anatomie comparée du YNHM au grand amphi du muséum.
Venez nombreux!
Plus d’infos sur http://ynhm.sciencesconf.org/
Journées Annuelles de la Société Française de Systématique, édition 2016
Phylogénie, taxonomie et nomenclature
Pour la première fois, les journées annuelles auront lieu en province, dans le prestigieux Château du Fontenil (16ème siècle), classé monument historique et lieu de chute de la météorite de l’Aigle (1803), la première météorite à avoir été intégrée à une collection d’un musée d’histoire naturelle.
Situé à 75 minutes en train de Paris (départ de Montparnasse 3-Vaugirard), la gare de l’Aigle est à 3 minutes du château en taxi. Les journées auront lieu les samedi 10 et dimanche 11 septembre 2016. Le plan est disponible suivant ce lien.
Le congrès débutera le samedi matin à 10:30h, suffisamment tard pour prendre un train à Paris entre 8:30h et 9h et arriver à la gare de l’Aigle à 10:11h. Il se terminera dimanche à 16h, ce qui permettra aux participants d’arriver à Paris pour 18h. Une quinzaine d’étudiants pourraient loger sur place pour un prix modique et pourront éventuellement arriver la veille et repartir le lendemain. Trois repas seront servis sur place.
Prix Augustin-Pyramus De Candolle 2016
La Société de Physique et d’Histoire naturelle de Genève (SPHN) a l’honneur de vous informer qu’elle attribuera en 2016 le Prix de Botanique institué par Augustin-Pyramus de Candolle en 1841 et destiné à récompenser l’auteur ou les co-auteurs de la meilleure monographie d’un genre ou d’une famille de plantes ou de champignons (lichens compris). Le Prix s’adresse de préférence à des chercheurs en début de carrière.
Les monographies doivent être inédites ou publiées après le 31 janvier 2012. Par monographie, on entend le traitement complet du groupe considéré et sa distribution en un système de classification hiérarchique. Elle comprend la description des caractères morphologiques externes et des caractères internes – anatomiques, caryologiques, physiologiques, génétiques et moléculaires – s’ils sont utiles à la distinction en sous-groupes. La présence d’une bibliographie complète, d’une synonymie critique et de clefs de détermination est requise. Le travail doit être conforme aux règles du Code International de Nomenclature. On acceptera les traitements partiels : monographie d’une sous-famille, d’une tribu, d’un sous-genre ou d’une section, à condition que le groupe soit clairement défini par rapport à ses voisins.
Le Prix est ouvert aux auteurs de toute nationalité ou pays. Les travaux peuvent être rédigés en latin, fran ̧cais, allemand, anglais, italien, espagnol ou portugais. Un résumé d’au plus 4000 mots sera rédigé en fran ̧cais ou anglais.
Les monographies peuvent être soumises sous forme électronique, sur le site : https://vdgbox.ville-geneve.ch/index.php/s/Ikd7IwMDYc5o73H,
ou sous forme imprimée, en deux exemplaires, à l’adresse :
Prix Augustin-Pyramus de Candolle
Conservatoire et Jardin botaniques de la Ville de Genève
Case postale 60
CH-1292 Chambésy – Suisse
Pour plus d’information, veuillez contacter prix-candolle.cjb@ville-ge.ch. Les candidatures, accompagnées du résumé et de(s) curriculum vitae, doivent être re ̧cues avant le lundi 4 avril 2016.
Le montant du Prix 2016 est de CHF 5’000. Si les monographies soumises sont jugées insuffisantes ou non conformes aux conditions de cette annonce, ce montant peut être réduit ou non attribué. Le Prix sera décerné en novembre 2016. Les droits sur la monographie primée restent la propriété de l’auteur. Les copies soumises ne seront pas retournées aux auteurs. Pour l’historique du Prix, voir www.unige.ch/sphn/Prixetbourses.
Le Président de la SPHN
Biosystema, n°30/2015 : L’arbre du vivant, trente ans de systématique
Coordonné par Patrick Martin, Sophie Nadot, Christophe Daugeron
Version papier, version numérique
Ce volume de Biosystema est particulier. En effet, il est le trentième numéro d’une série entamée en 1987 (cf. Matile et al. 1987, rééd. 2013), c’est-à-dire il y a près de trente ans, et il consacre, précisément, les trente ans d’existence de la Société française de systématique (cf. Dumoulin & Ollivier 2013).
Pour fêter cet anniversaire particulier, la SFS a articulé ses journées annuelles de novembre 2014 autour du thème de l’arbre du vivant, pris comme une métaphore décrivant les relations entre tous les êtres vivant sur Terre, dans un contexte évolutif. Par le biais de communications balayant l’ensemble du vivant, sous des angles très variés mais incluant presque toujours une approche phylogénétique, ces journées ont démontré, s’il en était besoin, le rôle central de la systématique dans la façon d’aborder l’histoire évolutive des organismes. Elles ont rassemblé un public nombreux et ont suscité des discussions animées, des débats parfois vifs autour des concepts associés à la systématique, mais, surtout, un enthousiasme bien présent.
Le présent volume entend partager et prolonger cet état d’esprit, en présentant une sélection des communications présentées au cours de ces journées. Le lecteur pourra apprécier les avancées, parfois spectaculaires, dans la connaissance de la phylogénie et/ou l’origine de taxons précis sur les trente dernières années.
SOMMAIRE
Les trente ans de la Société française de systématique, par Patrick Martin, Sophie Nadot et Christophe Daugeron (7)
Discours d’introduction aux Journées de la Société française de systématique, par Daniel Goujet (11)
La phylogénie des téléostéens : un chantier des méthodes en systématique, par Donald Davesne et Guillaume Lecointre (13)
L’origine des oiseaux, hier et aujourd’hui : petit retour historique sur un changement de paradigme, par Armand de Ricqlès (33)
L’arbre du vivant : classification phylogénétique des Annélides, par Patrick Martin (49)
Un aperçu de la phylogénie des oiseaux, par Alice Cibois et Jérôme Fuchs (69)
La phylogénie des proboscidiens (Mammalia) ; une question de méthode, par Pascal Tassy (81)
Phylogénie et classification : concepts, méthodologie générale et postulats requis, par Pierre Deleporte (99)
« Arbori-culture » : une typologie des « arbres » dans la culture phylogénétique, par Guillaume Lecointre (113)
Les deux biogéographies : biogéographie historique vs histoire géographique, par René Zaragüeta i Bagils (133)
Les paléoanthropologues sont-ils en meilleure position que les autres pour se permettre d’ignorer les règles de la systématique ? Un bref historique, par Valéry Zeitoun (155)
Conception et réalisation d’une exposition permanente consacrée à l’arbre du vivant, par Pierre Pénicaud (173)
Bulletin des éditions matériologiques: décembre 2015
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Journée scientifique de la SECM sur les collections au Muséum
1) Les collections aujourd’hui au Muséum
Les collections naturalistes
http://www.dailymotion.com/video/k5SC55k05iMlc4e9s4N
Les collections documentaires
http://www.dailymotion.com/video/k4tsCHP0CsbkR6e9sgU
La collection de minéralogie
http://www.dailymotion.com/video/k1SXuco9XM1mFAe9sYN
Les collections sensibles
http://www.dailymotion.com/video/k5dFTcnVxI17COe9IMn
Intérêt des bases de données de collections:
http://www.dailymotion.com/video/kRB5J4uxpHLI58e9IRI
débat : Comment ont évolué les collections au Muséum
http://www.dailymotion.com/video/k6X8ceYwGZiOGQe9t2y
2) Les collections dans les activités scientifiques du Muséum
Les collections nationales
http://www.dailymotion.com/video/k7ogWcirdI5ID9e9t5O
L’utilisation des collections par la recherche
http://www.dailymotion.com/video/k1x7G6NnJy3REwe9KUn
Les collections exposées
http://www.dailymotion.com/video/k6Vii7VqOYBWEoe9t8r
Les collections entreposées
http://www.dailymotion.com/video/k5maX9jHuU78jne9t9X
débat : Les collections au Muséum sont-elles suffisamment accessibles ?
http://www.dailymotion.com/video/k4e5iWumPVvzn3e9tbO
3) L’enrichissement des collections au Muséum
Les grandes expéditions
http://www.dailymotion.com/video/k4SeeneuAdUfqDe9td3
L’herbier des frères Crouan
http://www.dailymotion.com/video/k1AFvijuBH1sF2e9tfw
Les acquisitions de minéraux
http://www.dailymotion.com/video/k4qvanN9Bm7EACe9th0
La collection d’ostéologie
http://www.dailymotion.com/video/k1jn6EB2Ltlknye9tiI
Le rôle des associations
http://www.dailymotion.com/video/k2CfSJifrPW2b3e9tkQ
Le rôle des sciences participatives
http://www.dailymotion.com/video/k1iDcY01bcx6i2e9toS
clôture: Quel avenir pour les collections au Muséum ?
http://www.dailymotion.com/video/k5pIMOkDOi2vqDe9tpC